Netzwerk Analysen

Biologische Systeme sind als robuste Netzwerke konstruiert. Netzwerke auf dem Level der Transkriptome können durch die Analyse von Zeitreihen, von unterschiedlichen Geweben und von verschiedenen Bedingungen bzw. einer Kombination aller Effekte bestimmt werden. Dazu werden die Daten getrennt analysiert, normalisiert und durch Korrelations- und Regressions-basierte Methoden zu Netzwerken verrechnet.

networkanalysis

 

Laufende Forschungsprojekte

Übersicht

  • Evolutionäre Analyse von Netzwerken aus verschiedenen dikotylen und monokotylen Pflanzen
  • Ährenentwicklung bei Gräsern
  • Netzwerke zur Kontrolle der (C4)-Photosynthese
Abgeschlossene Projekte

Übersicht

Integrated analysis of monocot C4 leaf development using transcriptomics, metabolomics and physiology

https://scholar.google.de/scholar?oi=bibs&cluster=7270878364922593017&btnI=1&hl=en

Integrated analysis of dicot C4 leaf development using imaging and transcriptomics

https://scholar.google.de/scholar?oi=bibs&cluster=2735032856254851265&btnI=1&hl=en

Regression based network analysis of wheat transcriptome data

(eingereicht)

Ergänzende Informationen

Correlation-based network analysis

WGCNA: an R package for weighted correlation network analysis

RandomForest regression based network analysis

Inferring Regulatory Networks from Expression Data Using Tree-Based Methods