Probenabgabe – Proteinanalytik – FAQ:

kleine Moleküle, Proteinanalytik

• Die Abgabe von Proben zur Proteinanalytik ist nur nach Rücksprache und Besprechung des Ziels der Analyse und Probenvorbereitung mit dem Laborleiter möglich. Für die Probenvorbereitung (SDS-PAGE mit (Ent)Färben, in Lösung und in Gel Spaltung mit Proteasen) siehe (pdf File) unter Protokolle rechts.
• Die Probenabgabe ist nur mit einem Messantrag möglich, der mit SpecQuest erstellt wurde. Messanträge können nur von Personen erstellt werden, die registriert wurden
• Ansprechpartner: Dr. J. Sproß.
• Die Probenbeschriftung erfolgt mit dem von SpecQuest ausgegebenem Etikett. Der Probenname darf maximal 8 Zeichen haben. Folgende Angaben sind verpflichtend:
• Name des Auftraggebers
• Arbeitsgruppe des Auftraggebers
• Unvollständig beschriftete oder nicht Proben, die nicht eindeutig zugeordnet werden können, werden nicht bearbeitet!

 

• Proben und Messanträge werden direkt beim Laborleiter zum vereinbarten Termin abgegeben.
• Der Auftraggeber ist dazu verpflichtet, die Proben nach der Messung abzuholen! Die Ausgabe von Proben erfolgt durch den Laborleiter.

 

• Die Probe muss folgendermaßen vorbereitet sein:

Peptidproben (bottom-up Proteinanalytik) müssen in Wasser mit 3% Acetonitril und 0.1% Trifluoressigsäure gelöst sein. Die Konzentration muss zwischen 10-200 fmol/µL betragen (bitte angeben).

Proben für (native) Proteinanalytik mittels statischen nano-ESI Emittern müssen in Wasser mit 50% Acetonitril und 0.1% Ameisensäure bzw. für native Messungen in Wasser mit 1 mM Ammoniumacetat-Puffer abgegeben werden. Die Proteinkonzentration soll 10 µM sein.

Generell dürfen Protein- und Peptidproben keine Puffer enthalten, die beim Verdampfen des Lösungsmittels auskristallisieren! Dies führt zu Verunreinigungen und Ausfall des Massenspektrometers!
Lösungsmittel, wie DMSO oder DMF, sind für die Massenspektrometrie ungeeignet und dürfen nicht verwendet werden! (Bei SpecQuest für MS daher nicht anwählbar!) DMF kann beispielsweise dazu führen, dass die HPLC blockiert wird und erst wieder gereinigt werden muss.